Algen - Wasserflöhe - Fische, das sind die wichtigsten Vertreter der Nahrungskette in unseren Gewässern. Deshalb stehen diese Gruppen im Fokus der Risikobewertung für die Gewässerökosysteme. Für fast alle Chemikalien muss geprüft werden, ob sie Auswirkung auf diese Organismen haben. Neben diesen im freien Wasser lebenden Gruppen werden auch im Sediment lebende Organismen wie Zuckmückenlarven untersucht. Denn manche Chemikalien gehen aus dem Wasser ins Sediment über und könnten schädlich für die am Gewässergrund lebenden Würmer und Larven vieler Insekten sein.
Die Testung von Wasserpflanzen erfolgt mit den auf der Wasseroberfläche schwimmenden Wasserlinsen. Außerdem werden vor allem für Unkrautvernichtungsmittel und Wachstumsregulatoren die Auswirkungen auf im Wasserkörper lebende Pflanzen, wie Tausendblatt und Wasserschwaden ermittelt.